Für BioMed-S konzentriert sich die LFE Bioinformatik auf die Systembiologie, hier insbesondere auf die Netzwerk-orientierte Bioinformatik. Netzwerke sind wesentlich für das Verständnis diverser Phänomene von sozialen Netzwerken bis hin zu den neuronalen Netzen im Gehirn. Schwerpunktmässig untersucht die LFE Bioinformatik biologische Moleküle (Gene, Proteine, Metabolite, RNA) und deren Interaktionen. Ziel des ExpressionLab@LMU ist es, in Kollaboration mit Partnern aus der Biologie und Medizin neue bioinformatische Algorithmen für die Analyse von experimentellen Daten zu entwickeln und anzuwenden. Mithilfe der Messdaten werden dann molekulare Netzwerke unterschiedlicher Komplexitätsstufen einheitlich als Petri-Netze modelliert (NetworkLab@LMU).

Basierend auf den erzeugten Modellen untersuchen wir z.B. molekulare Mechanismen der Gen- und Protein-Regulation auf der System-Ebene.