NEAP Praktikum Netzwerk- und Expressionsdaten-Analyse (SS2018, NEAP)
Einen tieferen Überblick der Themen können sie von dem Neap`17 Buch erhalten: link.
Die liste der Themen ist daher identisch mit den im Buch aufgefüten Kapitel (wir geben die Themen hier in englischer Sprache an, da alle Präsentationen und Ergebnisse so verfasst werden müssen:
Gene Expression (and it's prediction)
Transcription Factor Binding
Open Chromatin
Alternative Splicing
Biological Networks
(long) non-coding RNAs
miRNAs
3D DNA Interactions
Mass-Spectrometry based Proteomics
Disease (example: Breast Cancer) Subtype Classification
Als Beispiel der interaktive Visualisation der Ergebnisse hier die erstellte Seite desTranscription Factor Binding Projects im Sommersemester 2017: link The content description is only available in German (click on the german flag).
Die liste der Themen ist daher identisch mit den im Buch aufgefüten Kapitel (wir geben die Themen hier in englischer Sprache an, da alle Präsentationen und Ergebnisse so verfasst werden müssen:
Als Beispiel der interaktive Visualisation der Ergebnisse hier die erstellte Seite desTranscription Factor Binding Projects im Sommersemester 2017: link The content description is only available in German (click on the german flag).
- Prof. Dr. Ralf Zimmer
- Dr. Gergely Csaba
- ggfs. für geeignete Teilprojekte weitere Betreuer des Lehrstuhls und des IPEK (LMU Medizin) for individual subprojects additional supervisors from the chair, IPEK (LMU medicine) and the Helmholtz center Munich
- Grundstudium Bioinformatik (Bachelor oder Diplom)Bachelor Bioinformatics
- Programmierpraktikum BioinformatikBioinformatics programming course
- Praktikum Genomorientierte BioinformatikPractical Genome-oriented bioinformatics
Mit Beginn des Praktikums werden alle nötigen Materialien auf einer internen Seite veröffentlicht At the beginning of the semester all required material will be provided at the internal Webpage (NEAP18 Interne Webseite)(NEAP18 Internal web page)
- Venter et al, The sequence of the human genome, Science. 2001 Feb 16;291(5507):1304-51.
- Lander et al, Initial sequencing and analysis of the human genome, Nature. 2001 Feb 15;409(6822):860-921.
- Eric Davidson, The regulatory genome - Gene Regulatory Networks in Development and Evolution, Academic Press, 2006.
- Science, Mar 28, 2008 issue, Gene regulation
- Nature, Sep 6, 2012 issue, ENCODE - Guidebook to the human genome
- Isabelle S Peter, Eric Davidson, Genomic Control Process - Development and Evolution, Academic Press, 2015.
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