Lehr- und Forschungseinheit Bioinformatik
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Interne Seite Oberseminar WS2019/20

Material
Die Planung für Projekt- und Journal Club Vorträge sind im GoogleDoc zu finden. ???
Datum Thema/Titel Autor
08.11.2019 Journal Club: ATAC2GRN Evi Berchtold
27.11.2019 Journal Club: Textmining/scRNAseq Markus Joppich
06.12.2019 Projektvortrag: ATAC evaluation Evi Berchtold
13.12.2019 Projektvortrag: Visions, projects, ... Ralf Zimmer

Next deadlines

whowhatwhen
Markus J.mirExplore12.06.2019 (We) 11:00 postponed...??
Markus G.EmpireRS add own-splicing-benchmark, resubmit - draft28.06.2019 (Fr) 10:00
neap, Alex, Gergelyfinal sprint review09.08.2019 (Fr) 10:00
EviATACseq footprinting auf publizierte Daten31.07.2019 (We) 10:00
Gergely(delayed: EmpiRe on microarray evals)TBA

Dates with Ralf

whodate
EviWe: 09:45
Markus J.We: 11:00
GergelyWe: 14:00
Markus GFr: 10:00
ConstantinFr: 11:00
AlexFr: 12:00

Deadlines history + decision log

whowhatwhendecision
LetM3C groupLetM3C group 28.06.2019 (Fr) 16:00 proceed as planned
EviHeatshock Paper (inkl. 46 C)19.06.2019 (We) 10:00paper submitted
Markus G.EmpireRS (splicing, benchmarks)03.06.2019 (Mo) 15:30 -> delayed 04.05.2019 (Di) 09:00 (Ralf date conflict)fall-back to own benchmark, use results for benchmark paper
ConstantinDraft paper: E.Coli in starvation03.06.2019 (Mo) 11:00 -> delayed 04.05.2019 (Di) 10:00 (Ralf date conflict)proceed as planned
EviATACseq footprinting Ergebnisse von publizierten Methoden26.06.2019 (We) 10:00 -> delayed 03.07.2019 (We) 10:00 (Ralf date conflict)proceed as planned
LetM3C groupLetM3C group 07.06.2019 (Fr) 16:00 proceed as planned

Paper plans

whowhatwhen
Alex/Gergely.Benchmark of document similarities on biomedical research documents 11.06.2019

OS schedule

14:00 - 14:15Projektenübersicht overview + "stand up"
14:15 - 14:20Kollaborationsübersicht
14:25 - 15:00
(25 + 5 + puffer)
Projektenvortrag
15:00 - 15:10Kaffepause
15:10 - 15:45
(25 + 5+ puffer)
Journalclub / Bachelor

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