Algorithmische Bioinformatik IIAlgorithmic Bioinformatics II

Aktuelle Hinweise

Für die Teilnahme an der Vorlesung und Übungen war eine Anmeldung bis Dienstag, den 24.10.2023, nötig.
Die Vorlesung wird über Moodle organisiert. Nach Anmeldung erhalten Sie zeitnah den Einschreibeschlüssel für die Moodle-Vorlesungsseite. Alle weiteren Informationen und Materialien erhalten Sie per Moodle.
Am Dienstag, den 17.10.2023, findet zur Zeit und im Raum der Vorlesung die Nachholklausur für Algorithmische Bioinformatik I statt.

Allgemeine Informationen

Dozentin:

Caroline Friedel

Umfang und Hörerkreis:

Zeit und Ort:

Di	10ct-12	Schellingstr. 3, S007
Do	10ct-12	Theresienstr. 39, B051

Übungen:

2 SWS Übung zur Vorlesung

Assistent*innen:
Elena Weiß
Katharina Reinisch
Tutor*innen:
Merit Back
Timo Reim
Helene Wetekam

Voraussetzungen

Stoff des Bioinformatik bzw. Informatik Grundstudiums.

Inhalt der Vorlesung

Die Vorlesung behandelt voraussichtlich die folgende Themen:

Modulprüfung

Hinweise zur Modulprüfung werden in der ersten Vorlesung am 19.10.2023 gegeben.

Literatur zur Vorlesung

G. Ausiello, P. Crescenzi, G. Gambosi, V. Kann, A. Marchetti-Spaccamela, M. Potasi: Complexity and Approximation: Combinatorial Optimization Problems and Their Approximability, Springer, 1999.
H.-J. Böckenhauer, D. Bongartz: Algorithmische Grundlagen der Bioinformatik: Modelle, Methoden und Komplexität, Teubner, 2003.
R.C. Deonier, S. Tavare, M.S. Waterman: Computational Genome Analysis, Springer, 2005.
R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchinson: Biological Sequence Analysis - Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press, 1998.
W.J. Ewens, G.R. Grant: Statistical Methods in Bioinformatics, Springer, 2001.
D. Gusfield: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology, Cambridge University Press, 1997.
V. Heun: Algorithmische Bioinformatik, Skriptum, 2001-2008.
A. Isaev: Introduction to Mathematical Methods in Bioinformatics, Springer, 2004.
N.C. Jones, P.A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004.
T. Koski: Hidden Markov Models for Bioinformatics, Kluwer Acedimics Publishers, 2001.
I. Wegener: Komplexitätstheorie - Grenzen der Effizienz von Algorithmen, Springer 2003.