Dr. Elena Weiß

E-Mail:
TelefonPhone:	+49-89-2180-4066
Adresseaddress :	Lehr- und Forschungseinheit Bioinformatik Teaching and Research Unit Bioinformatics Institut für Informatik Ludwig-Maximilians-Universität München
	Amalienstr. 17, 80333 MünchenMunich, Germany
Raum:	307 3. Etage

ForschungResearch

NGS data analysis
Transcriptomics in host/virus
HSV-1 infection

LehreTeaching

WS 24/25	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Bioinformatik: Netzwerke, Graphen und Systeme
WS 24/25	Betreuung des Tutor for the Programmierpraktikum (Blockteil)
WS 23/24	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Bioinformatik II
WS 23/24	Betreuung des Tutor for the Programmierpraktikum (Blockteil)
SS 2023	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Bioinformatik I
WS 22/23	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmen auf Sequenzen
WS 22/23	Betreuung des Tutor for the Programmierpraktikum (Blockteil)
SS 2022	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Bioinformatik: Bäume und Graphen
WS 21/22	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Systembiologie
WS 21/22	Betreuung des Tutor for the Programmierpraktikum (Blockteil)
SS 2021	Betreuung der Vorlesung Tutor for the Algorithmische Bioinformatik: Netzwerke, Graphen und Systeme
WS 20/21	Betreuung des Tutor for the GoBi
WS 20/21	Betreuung des Tutor for the Programmierpraktikum (Blockteil)

Betreute ArbeitenSupervised Work

2023

Papers

Elena Weiß, Thomas Hennig, Pilar Graßl, Lara Djakovic, Adam W. Whisnant, Christopher S. Jürges, Franziska Koller, Michael Kluge, Florian Erhard, Lars Dölken, Caroline C. Friedel, HSV-1 Infection Induces a Downstream Shift of Promoter-Proximal Pausing for Host Genes, Journal of Virology, vol. 97, no. 5, pp. e00381-23, 2023.

2021

Theses

Franziska Koller, Analysis of the role of cis-elements for changes in RNA polymerase II pausing, Bachelor Thesis, LFE Bioinformatik, LMU München, 2021.

BiBTex

PublikationenPublications

2023

Papers

Elena Weiß, Caroline C. Friedel, RegCFinder: targeted discovery of genomic subregions with differential read density, Bioinformatics Advances, vol. 3, no. 1, pp. vbad085, 2023.

Lara Djakovic, Thomas Hennig, Katharina Reinisch, Andrea Milic, Adam W. Whisnant, Katharina Wolf, Elena Weiß, Tobias Haas, Arnhild Grothey, Christopher S. Jürges, Michael Kluge, Elmar Wolf, Florian Erhard, Caroline C. Friedel, Lars Dölken, The HSV-1 ICP22 protein selectively impairs histone repositioning upon Pol II transcription downstream of genes., Nature communications, vol. 14, pp. 4591, 2023.

2022

Papers

Milan Hluchý, Pavla Gajdušková, Igor Ruiz de los Mozos, Michal Rájecký, Michael Kluge, Benedict-Tilman Berger, Zuzana Slabá, David Potěšil, Elena Weiß, Jernej Ule, Zbyněk Zdráhal, Stefan Knapp, Kamil Paruch, Caroline C. Friedel, Dalibor Blazek, CDK11 regulates pre-mRNA splicing by phosphorylation of SF3B1, Nature, vol. 609, no. 7928, pp. 829-834, 2022.

BiBTex

2020

Theses

Elena Weiß, Robustness of Gene Set Enrichment or Dependence on Differential Expression Processing, Master Thesis, LFE Bioinformatik, LMU München, 2020.

BiBTex

2018

Theses

Elena Weiß, Analysis of Predicted Mass Spectra and Peptide Identification, Bachelor Thesis, LFE Bioinformatik, LMU München, 2018.

BiBTex

LebenslaufCurriculum Vitae

Seit Okt 2020Since Oct 2020	Wissenschaftliche Mitarbeiterin, LFE Bioinformatik, LMU München PhD student, LFE Bioinformatics, LMU Munich
2018-2020	Studium der Bioinformatik an der LMU München und der TU München, Abschluss: M. Sc. Bioinformatics course, University of Munich (LMU Munich) and Technical University of Munich (TU Munich), M. Sc.
2018-2020	Studentische Hilfskraft, LFE Bioinformatik, LMU München Student assistant, Bioinformatics Group, University of Munich (LMU Munich)
2015-2018	Studium der Bioinformatik an der LMU München und der TU München, Abschluss: B. Sc. Bioinformatics course, University of Munich (LMU Munich) and Technical University of Munich (TU Munich), B. Sc.
2015	Abitur, Gutenbergschule Wiesbaden